0.16.6 文档
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绘制酶切位点、标签和确定性引导线。
用法
代码
geom_restriction_site(
mapping = NULL,
data = NULL,
label = TRUE,
label_style = c("enzyme_position", "enzyme", "position"),
label_order = c("auto", "enzyme_position", "position_enzyme"),
label_side = c("outside", "inside", "auto"),
leader = c("radial", "elbow", "straight"),
min_label_gap = NULL,
tick_length = 0.04,
label_offset = 0.18,
colour = "#202020",
linewidth = 0.28,
label_size = 3.2,
fontface = NULL,
family = NULL,
position = "identity",
show.legend = FALSE,
inherit.aes = FALSE,
...
)参数
- mapping, data
标准图层输入。
- label
是否绘制标签。
- label_style
标签显示酶及位置、仅酶名或仅位置。
- label_order
自动镜像顺序、酶名优先或位置优先。
- label_side
标签放在外侧、内侧或自动选择。
- leader
引导线路径。默认
"radial"测量实际文字框，分开位点锚点与最终径向位置，使用直连，或独立径向短线加扇形连接。所有面向酶位点的文字边缘按基因组顺序排列在同一紧凑圆形轮廓。密集侧向簇使用等距轮廓扇形，稀疏簇保留自然角度。旧"trunk"别名在 v0.16.1 删除，改用"radial"。"straight"从刻度尖端直连最终文字边缘，不绕行序列或其他线；"elbow"使用一个折点，尽可能先沿局部法线出发。所有路径共享标签位置及分组。- min_label_gap
标签槽之间的最小基因组比例，
NULL根据实际标签和设备推导紧凑默认值。- tick_length, label_offset
局部法线距离。
- colour, linewidth, label_size, fontface, family
固定外观。默认
fontface = NULL时，仅在该酶对完整输入切割一次时加粗酶名，坐标仍为常规字重；显式fontface关闭此自动区分。- position, show.legend, inherit.aes
标准图层参数。
- ...
其他几何参数。