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0.16.6 文档
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本页对应 ggchord 0.16.6,包含 0.16.0–0.16.4 开发阶段的累积改动。 正式标签、附件和发布时间以 GitHub Releases 为准。

RC修复与渐进教程

  • 按弦图→共线性图→质粒图编排模块,覆盖表格、导入、逐层构图及13个有来源的质粒案例。
  • 打磨四序列展示、统一背景和箭头图例,正确应用显式图例字号。
  • 修复内侧引物位置及酶切registry侧别,消除tibble可选列的多余警告。
  • 保留候选签名、灵活语法、别名和重导出,没有新增迁移或弃用;密集标签仍可能隐藏或跨图层交叠。

本版改进

  • 重组入门、完整工作流、任务指南与参考入口;首图教程覆盖安装、最小输入、读图、保存和排查,各专题提供本页准备代码。
  • 完整汉语函数参考包含参数、返回值和说明,保留同页英语切换;译文随源摘要核对。
  • 重设计排版、章节导航、图集与数据配色;按问题选用总体弦图、单序列圆图和局部 CDS 比较。顶栏常驻,手机目录与图片预留尺寸改善长页阅读。
  • 改用 pkgdown 和 Bootstrap 5 的包文档布局,保留同页语言切换、搜索、目录、代码折叠和复制。
  • 首页分别展示弦图、单序列圆图、共线性图;所有文档图支持放大及查看原始尺寸。
  • 例子优先使用随包数据和有来源的真实文件,先选取必要行列,再传入函数。
  • GC 轨道由实际 DNA 计算;同源例子按真实 CDS 序列核对,不捏造测量或分组。
  • 比对教程采用标准 BLAST 12 列,补充真实 PAF、BLASTp 读取、CDS 投影及格式转换。
  • 补充逐序列/逐链参数的支持范围、推荐写法和兼容边界;原生 aa 绘图另列方案。
  • 修复空引物命中表无法组合绘图的问题;四列基因表不再丢失默认链配色或忽略用户标度。
  • 用户原画保持完整分辨率和逐像素无损编码。函数签名与候选 API 保持一致, 默认调色板未更改;文档图按类别或数值选择的配色在例子中明确指定。

过去版本与迁移

完整 NEWS 原文(英语)保留历史变化。 历史条目中的旧入口不要直接作为当前调用;请使用迁移指南。 本文的本地开发检查不代表正式发布验收。