0.16.6 文档
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安装与学习路线
首页安装与环境准备选择合适的学习模块模块一『弦图』部分
1.1 输入表与字段含义1.2 生成与导入比对数据1.3 从骨架逐层添加1.4 方向、曲率与避障1.5 筛选与整理连接1.6 原始文件完整流程1.7 弦图综合展示模块二『共线性图』部分
2.1 复用弦图的数据2.2 只替换坐标系,再逐层添加2.3 跨行连接、避障与比例尺2.4 比较基因邻域2.5 局部、锚定与分段2.6 共线性综合展示模块三『质粒图』部分
3.1 DNA、注释与13个参考序列3.2 从圆圈到多层注释3.3 识别特征、引物与酶切3.4 13个质粒参考案例3.5 质粒综合实战按需查阅:数据与图层
数据与坐标导入和转换数据导入核酸和蛋白比对将蛋白区间转换为基因组坐标绘制注释与处理重叠放置和调整标签添加数据轨道设置配色、图例和主题按序列和链设置参数调整图形预览和保存图形学习地图与函数查阅
使用教程函数文档示例图集常见问题迁移到候选 API术语说明更新日志ggchord

GENOMIC VISUALIZATION · R / GGPLOT2
结构、关系与注释,一图呈现。
用图层组合弦图、共线性图与密集质粒注释。从真实序列、比对和注释,构建可复现的科研图形。
选择你的可视化任务
弦图 · 四条基因组的总体联系
从ggchord最早的弦图工作流出发:直线与正负曲率骨架、不同半径、自动显示方向、局部ribbon避障与逐一标注的精选特征。比对来自真实观测。 数据、完整代码与读图说明 →
共线性图 · 四序列、多图层、跨行比较
弦图的直线坐标表达。复用真实序列、比对和相似度配色,上下分列正负链特征,局部避障并向右绕行跨序列ribbon。共同图层可替换坐标;当前圆形专属参数的限制在教程中说明。 完整流程与各层含义 →
质粒图 · pETDuet-1 的密集注释
双链骨架、多层特征、五个参考引物,以及按同一切点合并的酶名称。图中输入包含 58 个切点和 20 个特征,文字按实际导出尺寸布局。 从简单圆图到完整质粒注释 →
按你的起点继续
示例优先使用 dplyr、purrr、tidyr 和原生 |>;图层组合遵循 ggplot2。需要更新旧代码时查看迁移指南。