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ggchord

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GENOMIC VISUALIZATION · R / GGPLOT2

结构、关系与注释,一图呈现。

用图层组合弦图、共线性图与密集质粒注释。从真实序列、比对和注释,构建可复现的科研图形。

选择你的可视化任务

弦图 · 四条基因组的总体联系

四基因组弦图:混合骨架曲率与实测相似度
四基因组弦图:混合骨架曲率与实测相似度 · 点击放大查看

从ggchord最早的弦图工作流出发:直线与正负曲率骨架、不同半径、自动显示方向、局部ribbon避障与逐一标注的精选特征。比对来自真实观测。 数据、完整代码与读图说明 →

共线性图 · 四序列、多图层、跨行比较

四基因组共线性图:分链特征与绕行的跨行连接
四基因组共线性图:分链特征与绕行的跨行连接 · 点击放大查看

弦图的直线坐标表达。复用真实序列、比对和相似度配色,上下分列正负链特征,局部避障并向右绕行跨序列ribbon。共同图层可替换坐标;当前圆形专属参数的限制在教程中说明。 完整流程与各层含义 →

质粒图 · pETDuet-1 的密集注释

pETDuet-1密集质粒图:特征、参考引物与合并酶切位点
pETDuet-1密集质粒图:特征、参考引物与合并酶切位点 · 点击放大查看

双链骨架、多层特征、五个参考引物,以及按同一切点合并的酶名称。图中输入包含 58 个切点和 20 个特征,文字按实际导出尺寸布局。 从简单圆图到完整质粒注释 →

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示例优先使用 dplyr、purrr、tidyr 和原生 |>;图层组合遵循 ggplot2。需要更新旧代码时查看迁移指南。