0.16.6 文档
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使用教程
按模块循序学习，再按需查阅共用技巧。每个模块从输入表出发，以完整展示图结束。
三条学习路线
模块一『弦图』部分表格 → 导入 → 骨架与图层 → 参数与避障 → 综合图 模块二『共线性图』部分复用数据 → 替换坐标 → 跨行路由 → 局部比较 → 综合图 模块三『质粒图』部分DNA与注释 → 圆圈与图层 → 识别 → 13个案例 → 密集综合图
依次阅读或按需查阅
安装与学习路线
模块一『弦图』部分
模块二『共线性图』部分
模块三『质粒图』部分
按需查阅：数据与图层
学习地图与函数查阅
功能与可运行证据
| 功能 | 使用教程 | 代码与结果 |
|---|---|---|
| 三种坐标模式 | 选择合适的学习模块 |
chord, circular, collinear · chord, circular, collinear |
| 真实记录比较 | 1.6 原始文件完整流程 |
realimport, realprepare, realchord, reallinear · realchord, reallinear |
| 完整圆图注释 | 3.5 质粒综合实战 |
plasmid · plasmid |
| 校验、清理与层次 | 数据与坐标 |
validation, cleaning, hierarchy
|
| 文件格式与适配器 | 导入和转换数据, 导入核酸和蛋白比对 |
adapters, formats, genbank, optionalranges, standardblast, protein · paf |
| 连接准备与统计 | 1.5 筛选与整理连接 |
ribbons · density |
| 区间与点连接 | 1.5 筛选与整理连接, 选择合适的学习模块 |
pointlinks, collinear · pointlinks |
| Feature 与 Position | 绘制注释与处理重叠 |
featurestack · featurestack |
| 自动与固定标签 | 放置和调整标签, 3.5 质粒综合实战 |
labellayouts, labels, plasmid · labelauto, labelradial, labelarc |
| 轴、参照条与区域 | 绘制注释与处理重叠, 2.5 局部、锚定与分段 |
decorations, focus · decorations |
| 定量轨道与数值域 | 添加数据轨道 |
tracks, multitrack · multitrack |
| 引物、酶切及 feature 搜索 | 3.3 识别特征、引物与酶切, 3.5 质粒综合实战 |
recognition, plasmid · plasmid |
| CDS 与连接投影 | 将蛋白区间转换为基因组坐标, 2.4 比较基因邻域 |
projection, linkprojection
|
| 显式 cluster 与 loci | 2.4 比较基因邻域 |
homologs · homologs |
| 局部、分段与源映射 | 2.5 局部、锚定与分段 |
focus, segment, mappingposition · focus |
| 标度、图例与主题 | 设置配色、图例和主题, 调整图形, 按序列和链设置参数 |
styling, adjustments, parameters · styling |
| 预览、结果与排序 | 预览和保存图形 |
save, preview, provenance, layoutresults
|
| 迁移与常见问题 | 迁移到候选 API, 常见问题 | migration |