0.16.6 文档
全站目录 · 按任务查找
安装与学习路线
首页安装与环境准备选择合适的学习模块模块一『弦图』部分
1.1 输入表与字段含义1.2 生成与导入比对数据1.3 从骨架逐层添加1.4 方向、曲率与避障1.5 筛选与整理连接1.6 原始文件完整流程1.7 弦图综合展示模块二『共线性图』部分
2.1 复用弦图的数据2.2 只替换坐标系,再逐层添加2.3 跨行连接、避障与比例尺2.4 比较基因邻域2.5 局部、锚定与分段2.6 共线性综合展示模块三『质粒图』部分
3.1 DNA、注释与13个参考序列3.2 从圆圈到多层注释3.3 识别特征、引物与酶切3.4 13个质粒参考案例3.5 质粒综合实战按需查阅:数据与图层
数据与坐标导入和转换数据导入核酸和蛋白比对将蛋白区间转换为基因组坐标绘制注释与处理重叠放置和调整标签添加数据轨道设置配色、图例和主题按序列和链设置参数调整图形预览和保存图形学习地图与函数查阅
使用教程函数文档示例图集常见问题迁移到候选 API术语说明更新日志常见问题
本页目录
调整尺寸后标签为什么不同?
可用物理空间改变了。使用显式尺寸预览与保存,并检查隐藏标签 诊断,不能由文字未显示直接推断输入行丢失。
旧参数为什么报错?
API 清理已删除旧别名的执行路径,见迁移表。同一语义不要混用新旧 写法。colour/color 函数拼写别名仍保留,文档优先使用 colour。
注释为什么不能作为 gene 绘制?
基因快捷层要求已知 +/- 链。未知链保留在通用注释层,不要猜成 +。 氨基酸区间需要显式投影。
直线模式的区间连接为什么没显示?
默认只连接相邻显示序列。应检查序列对选择、裁剪和校验结果,再有意使用明确 pairs 或 adjacent_only = FALSE。这个默认规则不删除原始输入记录。
包会计算比对或验证引物实验吗?
包可视化已有比对和计算搜索结果,不运行 BLAST、不由名称推断同源分组,也不验证湿实验 结果。搜索 confidence 不是概率。详见识别能力边界。
已测量诊断等于发布认证吗?
不等于。它描述一次指定渲染。平台、设备、字体、完整 vignette 和包检查属于明确授权 后的发布流程。验证范围见正式发布验收记录。
在哪里报告问题?
在 问题反馈页 提供小型输入、包与 ggplot2 版本、代码、目标宽高、设备和诊断结果。避免附带私有序列,通常可用合成数据复现。