2.1 复用弦图的数据

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共线性图是ggchord从弦图扩展出的直线视图。设计目标是保留共同数据和图层，尽可能通过替换坐标系完成转换。

相同的三张表

输入	必需列	共线性含义
seq_data	accver, length	每条序列占一行，共享bp横向比例
ribbon_data	qaccver, saccver, qstart, qend, sstart, send	两行之间的已有区间对应
gene_data	accver, start, end, strand	行上基因，正负链由Position上下分列

可选列和BLAST命名来历与1.1相同；相似度需要pident，标签需要anno。局部窗口的source字段用于保留原始坐标，不能将显示间隙解释为缺失DNA长度。

1.2的FASTA/GFF3/BLAST流程可以直接复用；已有PAF、GRanges、GInteractions通过适配器读入。蛋白比对必须先投影到已知CDS坐标，不能把aa直接画成bp。

下一页给出只替换coord的实际例子。显式圆形半径、曲率、ring和径向序列标签位置在当前共线性合同中会被拒绝，而不是悄悄忽略。将这些坐标特有样式留给各自展示图；“任意组合完美转换”仍是长期目标，不是当前保证。

共线性默认只连接相邻显示行；要保持弦图的连接集合，需要在共同图层明确 adjacent_only = FALSE。显示方向可手动指定或交给coord自动判断，两种入口不能同时使用。