0.16.6 文档
本页完整说明已译为现代汉语;函数、参数、代码和原始数据标识保留原样。 使用教程
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安装与学习路线
首页安装与环境准备选择合适的学习模块模块一『弦图』部分
1.1 输入表与字段含义1.2 生成与导入比对数据1.3 从骨架逐层添加1.4 方向、曲率与避障1.5 筛选与整理连接1.6 原始文件完整流程1.7 弦图综合展示模块二『共线性图』部分
2.1 复用弦图的数据2.2 只替换坐标系,再逐层添加2.3 跨行连接、避障与比例尺2.4 比较基因邻域2.5 局部、锚定与分段2.6 共线性综合展示模块三『质粒图』部分
3.1 DNA、注释与13个参考序列3.2 从圆圈到多层注释3.3 识别特征、引物与酶切3.4 13个质粒参考案例3.5 质粒综合实战按需查阅:数据与图层
数据与坐标导入和转换数据导入核酸和蛋白比对将蛋白区间转换为基因组坐标绘制注释与处理重叠放置和调整标签添加数据轨道设置配色、图例和主题按序列和链设置参数调整图形预览和保存图形学习地图与函数查阅
使用教程函数文档示例图集常见问题迁移到候选 API术语说明更新日志引物标签无框,使用引物颜色,默认显示一基闭区间结合坐标。引导线从方向弧箭头尖端(引物 3′ 端)出发。因子 start/end 的显示文字及保留坐标元数据均使用数值标签,与注释几何一致。
用法
代码
geom_primer_label_repel(
mapping = NULL,
data = NULL,
side = c("outside", "inside"),
show_location = TRUE,
colour = "#A020F0",
max_overlaps = Inf,
position = NULL,
show.legend = FALSE,
inherit.aes = FALSE,
...
)参数
- mapping, data
标准图层输入。
- side
引物引出标签相对于骨架所在侧。
"inside"保留内侧标签布局,包括图中共同存在外侧酶切或注释标签时。默认为"outside"。- show_location
是否在标签中包含结合范围。
- colour
引物弧颜色。
- max_overlaps
允许尚未解决的最大重叠数。
- position, show.legend, inherit.aes
标准图层参数。
- ...
传给
geom_feature()的其他参数。
