0.16.6 文档
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安装与学习路线
首页安装与环境准备选择合适的学习模块模块一『弦图』部分
1.1 输入表与字段含义1.2 生成与导入比对数据1.3 从骨架逐层添加1.4 方向、曲率与避障1.5 筛选与整理连接1.6 原始文件完整流程1.7 弦图综合展示模块二『共线性图』部分
2.1 复用弦图的数据2.2 只替换坐标系,再逐层添加2.3 跨行连接、避障与比例尺2.4 比较基因邻域2.5 局部、锚定与分段2.6 共线性综合展示模块三『质粒图』部分
3.1 DNA、注释与13个参考序列3.2 从圆圈到多层注释3.3 识别特征、引物与酶切3.4 13个质粒参考案例3.5 质粒综合实战按需查阅:数据与图层
数据与坐标导入和转换数据导入核酸和蛋白比对将蛋白区间转换为基因组坐标绘制注释与处理重叠放置和调整标签添加数据轨道设置配色、图例和主题按序列和链设置参数调整图形预览和保存图形学习地图与函数查阅
使用教程函数文档示例图集常见问题迁移到候选 API术语说明更新日志为通用基因组注释添加标签。
用法
代码
geom_feature_label(
mapping = NULL,
data = NULL,
label_orientation = c("feature", "horizontal", "radial", "tangent"),
label_side = c("outside", "inside", "auto"),
label_overlap = c("hide", "nudge", "allow"),
label_wrap = NULL,
label_rotation = NULL,
label_radial_offset = 0.04,
label_circum_offset = NULL,
label_circum_limit = NULL,
position = "identity",
show.legend = FALSE,
inherit.aes = FALSE,
...
)参数
- mapping, data
标准图层输入;通过
label映射注释文字。- label_orientation
支持
"feature"、"horizontal"、"radial"、"tangent"。"feature"使内部及相邻标签均沿注释切线;较紧凑的文字移到注释旁。- label_side
支持
"inside"、"outside"或"auto"。- label_overlap
固定标签的碰撞策略。
- label_wrap
可选的字符换行宽度。
- label_rotation
可选数值、向量或列表,旋转角度,默认 0。
- label_radial_offset
可选数值、向量或列表,径向偏移,默认 0.04。
- label_circum_offset
可选数值、向量或列表,周向偏移,默认 0。
- label_circum_limit
可选逻辑值、向量或列表,是否限制周向偏移,默认 TRUE。
- position
标签锚点使用的注释 Position。在
coord_collinear()中,省略时共享匹配注释层的轨道;显式 Position 只改变标签锚点,不移动多边形。若两组输入均有唯一feature_id,标签可取子集或重排,但序列标识、区间和链须一致。没有 ID 时,继承要求区间行及顺序完全相同。多个匹配几何层需要显式标签 Position 或无歧义注释 ID。- show.legend, inherit.aes
标准 ggplot2 图层参数。
- ...
其他文字参数。
