0.16.6 文档
本页完整说明已译为现代汉语;函数、参数、代码和原始数据标识保留原样。 使用教程
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安装与学习路线
首页安装与环境准备选择合适的学习模块模块一『弦图』部分
1.1 输入表与字段含义1.2 生成与导入比对数据1.3 从骨架逐层添加1.4 方向、曲率与避障1.5 筛选与整理连接1.6 原始文件完整流程1.7 弦图综合展示模块二『共线性图』部分
2.1 复用弦图的数据2.2 只替换坐标系,再逐层添加2.3 跨行连接、避障与比例尺2.4 比较基因邻域2.5 局部、锚定与分段2.6 共线性综合展示模块三『质粒图』部分
3.1 DNA、注释与13个参考序列3.2 从圆圈到多层注释3.3 识别特征、引物与酶切3.4 13个质粒参考案例3.5 质粒综合实战按需查阅:数据与图层
数据与坐标导入和转换数据导入核酸和蛋白比对将蛋白区间转换为基因组坐标绘制注释与处理重叠放置和调整标签添加数据轨道设置配色、图例和主题按序列和链设置参数调整图形预览和保存图形学习地图与函数查阅
使用教程函数文档示例图集常见问题迁移到候选 API术语说明更新日志对 ggplot2::guide_legend() 和 ggplot2::guide_colourbar() 的轻量封装,采用适合弦图的紧凑默认值,仍支持所有普通 ggplot2 图例参数。
用法
代码
guide_ggchord_legend(
title = ggplot2::waiver(),
theme = NULL,
position = NULL,
direction = NULL,
override.aes = list(),
nrow = NULL,
ncol = NULL,
reverse = FALSE,
order = 0,
size_scale = 1,
...
)
guide_ggchord_colourbar(
title = ggplot2::waiver(),
theme = NULL,
nbin = NULL,
display = "raster",
alpha = NA,
draw.ulim = TRUE,
draw.llim = TRUE,
angle = NULL,
position = NULL,
direction = NULL,
reverse = FALSE,
order = 0,
available_aes = c("colour", "color", "fill", "ribbon_fill", "gene_fill",
"feature_fill", "region_fill"),
size_scale = 1,
...
)
guide_ggchord_colorbar(
title = ggplot2::waiver(),
theme = NULL,
nbin = NULL,
display = "raster",
alpha = NA,
draw.ulim = TRUE,
draw.llim = TRUE,
angle = NULL,
position = NULL,
direction = NULL,
reverse = FALSE,
order = 0,
available_aes = c("colour", "color", "fill", "ribbon_fill", "gene_fill",
"feature_fill", "region_fill"),
size_scale = 1,
...
)参数
- title
图例标题。
- theme
可选图例专属主题。
- position, direction
图例位置和方向。
- override.aes
覆盖图例键 aesthetic 的列表。
- nrow, ncol
图例键排列的行列数。
- reverse
是否反转图例键顺序。
- order
图例顺序。
- size_scale
图例键、间距及文字的正缩放系数。自动图例由当前导出设备推导,直接调用默认 1。
- ...
传给对应 ggplot2 图例的其他参数。
- nbin
颜色条分箱数。
- display
颜色条显示方式。
- alpha
颜色条透明度覆盖值。
- draw.ulim, draw.llim
是否绘制上/下限刻度。
- angle
刻度标签角度。
- available_aes
图例接受的 aesthetic。
